因为1元注册公司，看似在印花税上占了便宜，但是实际上。如果公司在报税方面以及经营方面没有问题。公司盈利了以后，一元注册公司的弊端就会逐渐展现开来。

假设我们经营某个项目需要1000万元——不论是1元注册，还是1000万注册，要做成这个项目都得需要1000万元，即股东都要投入1000万元。

如果项目做成，公司增值到2000万元，自然持股人决定吸引投资，或者决定将公司转让。那么当初一元注册公司的弊病就显露无疑。

若1000万元注册公司，2000万元转让，不考虑契税，以及其他的杂费增值税部分须缴纳企业所得税250万元;自然人股东需要缴纳个人所得税150万元。合计缴纳400万元的税款。

若1元注册公司，完成项目总共投入1000万元，同样成功，最后2000万元转让，因为只有1元的原始成本，几乎可以忽略不计(为计算方便我们就不予考虑)，则转让增值部分须交纳企业所得税500万元，自然人股东还要交纳个人所得税300万元两项税收合计800万元。

只是因为公司注册资本不同，税负增加400万元的原因是“1元注册公司”几乎没有原始成本，在转让时全额计税。

不仅仅是转让，因为没有原始成本，企业发生其他变更时，也会产生类似的纳税成本，并涉及更多的税种。如果增资到正常的1000万还要加上时间成本以及足够的印花税，在股权转让，融资上市等等，以及代表一个公司实力的方面都没有太多好处。